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Cada distribución tiene erramientas específicas para construile al cliente un kernel a partir del código fuente. Este articulo tratará de compilar un kernel en un sistema Debian Sarge. Describe como crear un kernel personalizado usando las últimas modificaciones del código fuente del kernel, desde www.kernel.org. Así tendremos una configuración independiente de la que se hizo para la distribución. También se mostrará como parchear las fuentes del kernel, si sólamente fuera esto lo que necesitarás hacer.

http://www.howtoforge.com/kernel_compilation_debian