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Lo primero que tienes que hacer es tener instalado el paquete "gpac"

Name        : gpac                         Relocations: (not relocatable)
Version     : 0.4.5                             Vendor: RPM Fusion 
Release     : 3.fc10                        Build Date: lun 23 feb 2009 08:17:06 CET 
Install Date: vie 22 ene 2010 12:20:16 CET      Build Host: plague.lisas.de 
Group       : System Environment/Libraries   Source RPM: gpac-0.4.5-3.fc10.src.rpm 
Size        : 507648                           License: LGPLv2+ 
Signature   : DSA/SHA1, lun 23 feb 2009 16:04:50 CET, Key ID 855099b249c8885a 
Packager URL: http://gpac.sourceforge.net/ 
Summary     : MPEG-4 multimedia framework 
Description : 
GPAC is a multimedia framework based on the MPEG-4 Systems standard developed 
from scratch in ANSI C.  The original development goal is to provide a clean, 
small and flexible alternative to the MPEG-4 Systems reference software. 
GPAC features the integration of recent multimedia standards (SVG/SMIL, VRML,
X3D, SWF, 3GPP(2) tools and more) into a single framework. GPAC also features
MPEG-4 Systems encoders/multiplexers, publishing tools for content distribution
for MP4 and 3GPP(2) files and many tools for scene descriptions 
(MPEG4 <-> VRML <-> X3D converters, SWF -> MPEG-4, etc).

Bueno, para empezar seguramente está en tu repositorio, así que para instalarlo desde Linux:

(Fedora, CentOS, etc...) yum install gpac
(Ubuntu, Debian, etc...) apt-get install gpac

Para otras distribuciones: http://gpac.sourceforge.net/ Si listas su contenido, básicamente se compone de:

/usr/bin/MP4Box
/usr/bin/MP4Client
/usr/bin/MPEG4Gen
/usr/bin/SVGGen
/usr/bin/X3DGen
/usr/share/doc/gpac-0.4.5
/usr/share/doc/gpac-0.4.5/AUTHORS
/usr/share/doc/gpac-0.4.5/BUGS
/usr/share/doc/gpac-0.4.5/COPYING
/usr/share/doc/gpac-0.4.5/Changelog
/usr/share/doc/gpac-0.4.5/README
/usr/share/doc/gpac-0.4.5/TODO
/usr/share/gpac
/usr/share/gpac/gpac.mp4
/usr/share/man/man1/gpac.1.gz
/usr/share/man/man1/mp4box.1.gz
/usr/share/man/man1/mp4client.1.gz

Lo que quiere decir, que las aplicaciones para trabajar las que están en /usr/bin.

Podremos hacer algunas cosas tan interesantes como:

http://gpac.sourceforge.net/home_screens.php

En Resumen MP4Box sirve para

• Para la codificación/decodificación de lenguajes de presentación, como
  MPEG-4 o XMT W3C SVG en/desde los formatos binarios, como MPEG-4 BIFS o LASeR,
• Para manipular archivos ISO como MP4, 3GP: añadir, eliminar,
  multiplexación de audio, video y presentación de los datos (incluidos
  los subtítulos) de diferentes fuentes y en diferentes formatos,
• Para realizar el cifrado de los flujos de datos
• Para conectar los metadatos a los streams individuales o al conjunto
  para producir un único archivo ISO MPEG-21 compatible o híbrido
  MPEG-4/MPEG-21 archivos
• Para el envasado y el etiquetado de los resultados para el streaming,
  descarga y reproducción en dispositivos diferentes (por ejemplo:
  teléfonos, PDA) o para diferentes programas informáticos (por ejemplo,
  iTunes).

Es ampliamente utilizado: Por académicos, la comunidad de vídeo y es notablemente utilizados
en los servicios de Google Video para la preparación de archivos multimedia y para su
reproducción en el iPod y PlayStation.

MP4Box puede utilizarse para volver a empaquetar contenido existente compatible con archivos
media de ISO (MP4, 3GP, 3G2, OMA DCF). Tenga en cuenta sin embargo que MP4Box no codificará
el contenido de las imagenes, audio y vídeo, deberá usar herramientas externas
para este propósito.

• Transformar un fichero DivX a un MP4:

  MP4Box -add file.avi new_file.mp4

• Añadir un segundo track audio al fichero previo:

MP4Box -add audio2.mp3 new_file.mp4

• MP4Box pueden importar sólo piezas o medios específicos desde un
  contenedor existente. Para obtener los medios de comunicación compatibles
  que se pueden importar desde un contenedor:

MP4Box -info file.avi

MP4Box -info file.mpg

MP4Box -info file.ts

• Añadir a single media desde un contenedor:

MP4Box -add file.mpg#audio new_file.mp4




Para más información, aquí os dejo este enlace:

http://gpac.sourceforge.net/packager.php

Por supuesto, gpac tiene un Player (GUI), si os gusta averiguarlo...

Básicamente, es una extensión similar DownloadHelper, que puedes utilizar con Firefox.

Prácticamente, puedes hacer el mismo trabajo...

También puedes utilizar DivX Converter, del que ya hemos hablado en nuestra página de Linux.

Pero vamos... si te quieres complicar la vida, como somos muy amigo de hacerlo un poquito más difícil, aquí te dejamos algunos enlaces, y luego si eso... tu decides.

En rpm:

http://rpm.pbone.net/index.php3/stat/4/idpl/13156858/com/Osmo4-0.4.5-0.pm.5.2.i586.rpm.html

En deb:

No lo he encontrado, pero bajate el rpm, utiliza el paquete alien, y espero que funcione.